PAC – Génotypage à haut débit à l’aide des puces 7K et 25K pour le blé

Amendement no1

Sous « EXIGENCES », ajoutez les travaux supplémentaires suivants :

Période initiale :
1) extraction d'ADN à partir de feuilles de blé et d'avoine pour un total de 25 plaques (96 échantillons par plaque);
2) réaliser le génotypage HT sur 20 plaques (96 échantillons par plaque) d’échantillons d’avoine en utilisant la matrice 7k v2 :
3) effectuer le génotypage HT sur 5 plaques (96 échantillons par plaque) d’échantillons d’ADN de blé à l’aide de la puce 25K pour le blé;
4) effectuer une manipulation des données après traitement afin que le produit final soit une matrice de données génotypiques adaptées à l’analyse génétique en aval.

Fournir un ou plusieurs des services suivants au cours des années d’option 1 et 2, si nécessaire :
• Extraction d'ADN à partir de feuilles de blé, d'avoine ou d'orge jusqu'à 45 plaques (96 échantillons par plaque);
• Réaliser un génotypage HT sur un maximum de 15 plaques (96 échantillons par plaque) d'échantillons d'avoine en utilisant la matrice 7k v2;
• Réalisez un génotypage HT sur jusqu'à 15 plaques (96 échantillons par plaque) d'échantillons d'ADN de blé à l’aide de la puce 25K pour le blé;
• Réalisez un génotypage HT sur un maximum de 15 plaques (96 échantillons par plaque) d'échantillons d'ADN de blé à l’aide de la puce 7K pour le blé;
• Réalisez un génotypage HT sur un maximum de 15 plaques (96 échantillons par plaque) d'échantillons d'ADN d'orge à l’aide de la puce 15K pour l‘orge;
• Réalisez un génotypage HT sur un maximum de 15 plaques (96 échantillons par plaque) d'échantillons d'ADN d'orge à l’aide de la puce 4K pour l‘orge;
• Effectuer des manipulations de données post-traitement afin que le produit final soit une matrice de données génotypiques adaptée à l’analyse génétique en aval.

VALEUR ESTIMÉE : Augmentation à 135 480,00 USD

Services optionnels, au besoin :
No 1 - Augmentation à 247 260,00 USD
No 2 - Augmentation à 249 600,00 USD

Le préavis d’adjudication de contrat (PAC) est un avis public destiné à la collectivité des fournisseurs pour lui faire part de l’intention d’Agriculture et Agroalimentaire Canada d’attribuer à un fournisseur sélectionné à l’avance un contrat de service, ce qui permet aux autres fournisseurs de signaler leur intérêt à soumissionner en présentant un énoncé des capacités. Si aucun fournisseur ne présente un énoncé des capacités qui satisfait aux exigences établies dans le PAC, au plus tard à la date de clôture indiquée dans le PAC, l’agent de négociation des contrats peut procéder à l’attribution du contrat au fournisseur sélectionné à l’avance.

EXIGENCES

Agriculture et Agroalimentaire Canada conclura un marché avec SGS North America Inc. pour :

Fournir les services suivants au cours de la période initiale :

1) effectuer des contrôles de qualité préalables à l’analyse sur un maximum de 6 500 échantillons d’ADN;
2) effectuer le génotypage HT sur un maximum de 6 500 échantillons d’ADN de blé et de blé dur à l’aide de la puce 7K à basse densité ou de la puce 25K
à moyenne densité pour le blé de TraitGenetics;
3) effectuer la manipulation des données post-traitement afin que le produit final soit une matrice de données génotypiques adaptée à l’analyse
génétique en aval.

Fournir les services suivants au cours de la première et de la deuxième année d’option, au besoin :

1) effectuer des contrôles de qualité préalables à l’analyse sur un maximum de 10 000 échantillons d’ADN;
2) effectuer le génotypage HT sur un maximum de 10 000 échantillons d’ADN de blé et de blé dur à l’aide de la puce 7K à basse densité ou de la puce
25K à moyenne densité pour le blé de TraitGenetics;
3) effectuer la manipulation des données post-traitement afin que le produit final soit une matrice de données génotypiques adaptée à l’analyse
génétique en aval.

CRITÈRES D’ÉVALUATION DE L’ÉNONCÉ DES CAPACITÉS

Tout fournisseur intéressé doit démontrer, au moyen d’un énoncé des capacités, qu’il satisfait aux exigences suivantes :

- être un revendeur à valeur ajoutée ou un distributeur autorisé de la puce 7K à basse densité et de la puce 25K à moyenne densité pour le blé de SGS Institut Fresenius TraitGenetics.

DURÉE DU CONTRAT

Du 1er novembre 2024 au 31 mars 2025 (période initiale), avec une option de prolongation de deux ans (année 2 et année 3).

VALEUR ESTIMÉE : 90 000,00 USD

Services optionnels, au besoin :
 
No 1 - du 1er avril 2025 au 31 mars 2026 – 138 000,00 USD
No 2 - du 1er avril 2026 au 31 mars 2027 – 138 000,00 USD

FOURNISSEUR SÉLECTIONNÉ À L’AVANCE

SGS North America, Inc.
1405 32 nd Ave.
Brookings, SD 57006
USA

JUSTIFICATION DU RECOURS À UN FOURNISSEUR UNIQUE

Le contrat de génotypage concurrentiel précédent du Centre de recherche et de développement de Swift Current d’Agriculture et Agroalimentaire Canada a été attribué à SGS Institut Fresenius TraitGenetics et, par conséquent, les plateformes de recherche de marqueurs moléculaires d’analyse de la sélection génomique ont été développées en fonction des puces pour le blé de SGS Institut Fresenius TraitGenetics. SGS Institut Fresenius TraitGenetics est le propriétaire et le développeur des puces 7K à basse densité et 25K à moyenne densité pour le blé, ainsi que le détenteur des droits de propriété intellectuelle. L’entreprise n’autorise aucun revendeur à valeur ajoutée ou distributeur pour ses puces. Elle est donc la seule autorité en ce qui concerne les services de génotypage à haut débit à l’aide des puces 7K à basse densité et 25K à moyenne densité pour le blé.

Exception au Règlement sur les marchés de l’État
L’alinéa 6 d) a été invoqué pour ce marché, car un seul fournisseur (personne ou entreprise) est en mesure d’exécuter le contrat.

PRÉAVIS D’ADJUDICATION DE CONTRAT (PAC)

L’État fait savoir par la présente qu’il a l’intention de n’inviter à soumissionner que l’entreprise susmentionnée. Pour toute question concernant ce contrat, veuillez vous adresser à l’autorité contractante.

Un préavis d’adjudication de contrat (PAC) permet aux ministères et aux organismes de publier un avis, pendant au moins quinze (15) jours civils, pour informer la collectivité des fournisseurs de leur intention d’attribuer un contrat pour des biens, des services ou des travaux de construction à un fournisseur sélectionné à l’avance. Si, pendant la période d’affichage, aucun fournisseur ne présente d’énoncé des capacités répondant aux exigences précisées dans le PAC, l’autorité contractante pourra alors procéder à l’attribution du contrat. Toutefois, s’il s’avère qu’un énoncé des capacités remplit les exigences énoncées dans le PAC, l’autorité contractante lancera alors un processus d’appel d’offres en bonne et due forme.

DATE ET HEURE DE CLÔTURE POUR LA PRÉSENTATION D’UN ÉNONCÉ DE CAPACITÉS

Les fournisseurs ont jusqu’au 10 septembre 2024, 11 h (HNC), pour présenter un énoncé des capacités.

Les fournisseurs qui se considèrent comme entièrement qualifiés et qui sont disponibles pour fournir les services précisés peuvent présenter un énoncé des capacités par courriel à l’autorité contractante dont le nom figure dans le présent préavis, au plus tard à la date de clôture du présent préavis. L’énoncé des capacités doit clairement démontrer que le fournisseur satisfait les exigences indiquées dans le préavis.

Le numéro de la demande, le nom de l’autorité contractante et la date de clôture du PAC doivent être inscrits dans l’énoncé des capacités.

La Couronne se réserve le droit de négocier tout achat avec les fournisseurs.

AUTORITÉ CONTRACTANTE
Melissa Smith, Spécialiste des contrats
Agriculture et Agroalimentaire Canada
Centre de services de l’Ouest
2010, 12e Avenue, bureau 300
Regina (Saskatchewan) S4P 0M3
Téléphone : 306-515-4796
Courriel : melissa.smith3@agr.gc.ca